أدت مؤسسات الدولة المصرية الموصوفة بالعميقة دورا رئيسيا في إنجاح الثورة المضادة والانقلاب على ثورة 25 يناير، وكان الجيش والشرطة والقضاء والإعلام أبرز أدوات الدولة العميقة.