Snake arrive en Amérique du sud et découvre que la SMP française Pieuvre Armement, sous le contrôle d'Outer Heaven, est au courant de son arrivée très prochaine. <br /><br />De plus, Vamp, le dernier membre de la Dead Cell (que l'on croyait mort à Manhattan après l'incident de la Big Shell) est visiblement dans le camp de Liquid ! Et Laughing Octopus, un commando dans un tenue ressemblant à une pieuvre, est également à ses trousses... La mission s'annonce bien plus dure que prévu.
