Dans un ultime effort pour contrer les tentatives de domination mondiale par la diabolique société Umbrella, une organisation clandestine composée d'anciens membres des Stars et d'anciens employés d'Umbrella a été créée.<br />Une nouvelle arme biologique conçue par les laboratoires d'Umbrella est apparemment transporté sur un luxueux bateau de croisière, le Starlight, traversant actuellement l'océan Atlantique, en direction de l'Europe.<br />Léon S. Kennedy (que l'on a découvert dans Resident Evil 2) a été dépêché sur place pour éliminer l'ABO (Arme Bio-Organique). D'après son dernier rapport, il se trouverait à bord du Starlight, traversant actuellement l'océan Atlantique.<br />L'histoire commence au sein du quartier général de l'organisation clandestine où Barry reçoit un ordre de mission : il doit partir sur le Starlight afin de retrouver Leon S. Kennedy qui ne donne plus de nouvelle et l'aider à retrouver et éliminer l'ABO.
